Το Ισραήλ έχει εξασφαλίσει μια σειρά από συμβατικά δικαιώματα από την Lockheed-Martin που της δίνουν το δικαίωμα να κάνει παραλλαγές και βελτιστοποιήσεις στα F-35, ώστε να προσαρμοστούν στις συνθήκες μαχών της Μέσης Ανατολής αλλά και για να αποκτήσει κυριαρχία σε επίπεδο Μέσης Ανατολής έναντι των Αράβων με τις "ευλογίες" των ΗΠΑ.
Η αεροπορική βάση Nevatim του Ισραήλ φιλοξενεί εγκαταστάσεις συντήρησης F-35 που διαθέτουν τα απαραίτητα εργαλεία επισκευής και το κατάλληλα εκπαιδευμένο προσωπικό για τη διεξαγωγή όχι μόνο συντήρησης ρουτίνας, αλλά και επισκευών πέραν αυτών.
Οι υπόλοιπες χώρες εταίροι του προγράμματος F-35 υποχρεούνται από τη σύμβαση της εταιρίας να κάνουν οποιαδήποτε σημαντική συντήρηση του αεροσκάφους σε εγκαταστάσεις της Lockheed. Αυτό φυσικά δεν είναι μόνο επικερδές για την εταιρία, εξασφαλίζει επίσης ότι οι τεχνικές λεπτομέρειες των F-35 παραμένουν μυστικές.
Το Ισραήλ είναι μια μοναδική περίπτωση, διότι οι απαιτητικές γεωπολιτικές εξελίξεις στην περιοχή απαιτούν την ταχεία ικανότητα εγχώριας κατασκευής.
Ένα από τα μεγαλύτερα πλεονεκτήματα του F-35 είναι η ικανότητά του να συλλέγει σε πραγματικό χρόνο πληροφορίες από το πεδίο της μάχης, ώστε στη συνέχεια να τις χρησιμοποιεί προς νεότερη ενημέρωση του πεδίου όπου διεξάγονται πολεμικές επιχειρήσεις.
Αυτή η τεχνολογία είναι γνωστή ως δυνατότητα command, control, communications, and computing (C4) architecture, και είναι η τελευταία υπερσύγχρονη τεχνολογία.
Στο Ισραήλ, έχει επιτραπεί να δημιουργήσει τη δική της εφαρμογή που θα χρησιμοποιεί τις συγκεντρωμένες πληροφορίες από τα F-35 στέλνοντάς τες στο δικό τους δίκτυο συλλογής πληροφοριών.
Η εταιρία Lockheed επέτρεψε στο Ισραήλ να τροποποιήσει το τυπικό σύστημα BAE EW suit με ένα παρόμοιο σύστημα Ισραηλινής κατασκευής, πιθανώς με ένα είδος προσαρτημένου ατρακτιδίου (attachable pod) το οποίο μπορεί να προσαρμοστεί στις συνθήκες της Μέσης Ανατολής.
Ένα από τα συστήματα όπλων που χρησιμοποιεί το Ισραήλ στην πλατφόρμα των F-35 είναι τα «Spice family of guidance kits».
