Ὁ ναὸς αὐτός, ποὺ χτίστηκε πρὸ περίπου πεντακοσίων ἐτῶν, ἐγνώρισε περίοδο ἀκμῆς στὰ τέλη τοῦ 19ου καὶ ἀρχὲς 20οῦ αἰῶνος, ὅταν ἐκεῖ λειτουργοῦσε ὁ ἅγιος Νικόλαος Πλανᾶς, καὶ ἔψαλλαν οἱ Σκιάθιοι λογοτέχνες Ἀλέξανδρος Παπαδιαμάντης καὶ Ἀλέξανδρος Μωραϊτίδης. Στὴν διάρκεια τῆς γερμανικῆς κατοχῆς ὁ ναὸς κατέρρευσε καὶ μετὰ ἑξήντα ἔτη, μὲ τὴν πρωτοβουλία τῆς Ἑταιρείας Παπαδιαμαντικῶν Σπουδῶν καὶ τὶς ἐνέργειες τοῦ Ὑπουργείου Πολιτισμοῦ ὁ ναὸς ἀναστηλώθηκε στὸ ἀρχικὸ σχέδιο καὶ λειτούργησε μὲ μηνιαία τέλεση ἀγρυπνικῶν, γιὰ ὀκτὼ ἔτη, ἕως τὸ 2012. Ὅλο τὸ οἰκοδομικὸ τετράγωνο ἀνήκει στὸ Μουσεῖο Νεότερου Ἑλληνικοῦ Πολιτισμοῦ καὶ ἐπὶ δέκα ἔτη ἔλαβαν ἐκτενεῖς ἐργασίες ἀνακατασκευῆς τῶν κτιρίων τοῦ Μουσείου, ἑπομένως δὲν ετελοῦντο ἀκολουθίες στὸν ναό.
Την Τρίτη λοιπόν, μνήμη τῶν ἁγίων ἀναργύρων Κύρου καὶ Ἰωάννου, μὲ τὴν εὐλογία τοῦ μακαριωτάτου ἀρχιεπισκόπου μας, κ. Ἱερωνύμου, ὁ ὁποῖος εἶχε τελέσει δύο φορὲς ἱερὰ ἀγρυπνία στὸν ναό, ἤδη ἀμέσως μετὰ τὴν ἀνάῤῥυσή του στὸν θρόνο τῶν Ἀθηνῶν, ἔγινε ἡ ἐπανέναρξη τῆς ἐπίσημης τελέσεως τῶν ἱερῶν ἀκολουθιῶν. Ὁ μακαριώτατος, ἀρχαιολόγος ὁ ἴδιος, δὲν παύει νὰ ἀποδεικνύει τὸ ἀνύστακτο ἐνδιαφέρον του γιὰ τὴν συντήρηση καὶ ἀνάδειξη ὅλων τῶν χριστιανικῶν μνημείων, ἀλλὰ πρωτίστως γιὰ τὴν δίκαιη ἀπόδοσή τους στὸν σκοπὸ τῆς ἱδρύσεώς τους, δηλαδὴ τὴν λειτουργικὴ χρήση, τὴν τέλεση ἱερῶν ἀκολουθιῶν. Γιὰ τοῦτο καὶ ἐνήργησε, πάντα σὲ ἀγαστὴ συνεργασία μὲ τὶς ἀρμόδιες ὑπηρεσίες τοῦ Ὑπουργείου Πολιτισμοῦ, τὸ Μουσεῖο Νεότερου Ἑλληνικοῦ Πολιτισμοῦ καὶ τὴν ἑταιρεία Παπαδιαμαντικῶν Σπουδῶν, ὥστε νὰ ἐπανεκκινήσουν οἱ ἱεροπραξίες στὸν ναὸ τοῦ Προφήτου Ἐλισσαίου.
Στὴν θεία λειτουργία ἔψαλε χορὸς ὑπὸ τὸν μουσικολόγο κ. Ἰωάννη Ἀρβανίτη, ἐνῷ παρέστη συμπροσευχόμενος ὁ πρωτοσύγκελλος τῆς ἱερᾶς ἀρχιεπισκοπῆς Ἀθηνῶν, ἀρχιμανδρίτης Βαρνάβας Θεοχάρης, ὁ ὁποῖος, ἐντολῇ τοῦ ἀρχιεπισκόπου, εἶχε συντονίσει τὴν ὀργάνωση αὐτῆς τῆς λειτουργικῆς συνάξεως. Πρὸ τῆς ἀπολύσεως, ὁ π. Βαρνάβας ὁμίλησε στὸ ἐκκλησίασμα, μεταφέροντας τὶς εὐχὲς τοῦ Μακαριωτάτου μας· ἀναφέρθηκε ἐπίσης στὸν βίο τοῦ προφήτου Ἐλισσαίου, τοῦ ἁγίου Νικολάου Πλανᾶ, καθὼς καὶ στὶς μεγάλες προσωπικότητες τοῦ πνεύματος, οἱ ὁποῖοι συμμετεῖχαν στὶς ἀγρυπνίες. Πρόσθεσε δὲ τὴν ὑπόσχεση τῆς τακτικῆς λειτουργικῆς ζωῆς στὸν ναό, ποὺ θὰ ἀνακοινώνονται ἐγκαίρως στὸν ἱστοχῶρο τῆς Ἀρχιεπισκοπῆς καὶ τὸ ῥαδιόφωνο τῆς Ἐκκλησίας.
